Thursday, November 24, 2011

Workshop on sawah technology for sub-Saharan Africa


A workshop, entitled ‘Improving and sustaining rice production under changing climatic conditions’, was organized, 22–24 November, in Kumasi, Ghana, to showcase the principles and practices of the sawah technology. The technology was developed by Prof. Toshiyuki Wakatsuki of the Kinki University, Japan, to improve soil and water management, irrigation and fertilizer efficiency to increase rice productivity in African lowlands.

The workshop was organized under the auspices of the Council for Scientific and Industrial Research (CSIR) with technical and financial support from the Kinki University, Japan, JIRCAS and AfricaRice. It brought together participants from Japan, Ghana, Indonesia, Nigeria and Senegal.

Wednesday, November 23, 2011

AfricaRice Scientist wins 2011 Japan International Award for Young Researchers

Dr. Jonne Rodenburg, Agronomist with special focus on weed science at the Africa Rice Center (AfricaRice) has won the 2011 Japan International Award for Young Agricultural Researchers for spearheading the development of integrated weed management strategies for resource-poor rice farmers in sub-Saharan Africa (SSA).

The Japan International Award for Young Agricultural Researchers recognizes outstanding performance and research achievements in agriculture, forestry, fisheries and related industries in developing countries.

Dr. Rodenburg, who is a Dutch national, is among the three recipients of this year’s award, which was presented recently in Tsukuba City, Japan, by Dr. Eitarou Miwa, Chairman of the Japan Agriculture, Forestry, and Fisheries Research Council (AFFRC) in the presence of Dr. Masa Iwanaga, President of the Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS).

“It is the second time our young researchers have won this prestigious award. We are proud of them and honored by the recognition they have received from Japan for their work,” said AfricaRice Director General Dr. Papa Abdoulaye Seck.

In collaboration with national and international research partners, Dr. Rodenburg has identified effective (genetic) mechanisms to achieve resistance against the most important parasitic weeds in rain-fed rice systems and a number of highly resistant and tolerant varieties for immediate use in farmers’ fields. He has also identified varieties with good weed competitiveness that can be recommended for use by farmers.

 “The results of his research on resistance of rice varieties to parasitic weeds will be very useful for rice breeding programs,” said Dr. Marco Wopereis, AfricaRice Deputy Director General, Research for Development.  “If resource-poor farmers can fight against such weeds through their choice of seed – that would be a major breakthrough because to date only crop management approaches are available to combat these weeds.”

According to AfricaRice experts, the losses in rice production in SSA due to weeds equate to half the current rice imports in the region and smallholder farmers have a limited range of effective and affordable weed management technologies.

Dr. Rodenburg supervises many MSc and PhD students from a wide range of nationalities and has built up a large network of research partners around the globe and within Africa. He is a prolific scientist and also contributes to the generation of farmer training material such as videos, radio-scripts and technical information sheets.

Un chercheur d’AfricaRice remporte le prix international japonais 2011 des jeunes chercheurs

Dr Jonne Rodenburg, malherbologue au Centre du riz pour l’Afrique (AfricaRice), a remporté le Prix international japonais des jeunes chercheurs agricoles pour avoir contribué au développement de stratégies intégrées de gestion des adventices pour les riziculteurs pauvres d’Afrique subsaharienne (ASS).

Le prix international japonais des jeunes chercheurs agricoles récompense des performances exceptionnelles et des réalisations dans les domaines de la recherche agricole, de la foresterie, de la pêche et des industries connexes dans les pays en voie de développement.

Dr Rodenburg qui est citoyen hollandais, est l’un des trois récipiendaires du prix de cette année, qui a été décerné récemment à Tsukuba City, Japon par Dr Eitarou Miwa, président du Conseil Japonais pour l’Agriculture, la Foresterie, la Pêche et la Recherche (AFFRC) en présence de Dr Masa Iwanaga, Président du Centre japonais de la recherche international pour les sciences agricoles (JIRCAS).

« C’est la seconde fois qu’un de nos jeunes chercheurs remporte ce prix prestigieux. Nous sommes fiers d’eux et sommes honorés par la reconnaissance du Japon pour leurs travaux », a affirmé Dr Papa Abdoulaye Seck, Directeur général d’AfricaRice.

En collaboration avec les partenaires de la recherche nationale et internationale, Dr Rodenburg a identifié des mécanismes (génétiques) efficaces de la résistance aux adventices parasites les plus nocifs dans les systèmes rizicoles pluviaux, et un nombre de variétés résistantes et tolérantes immédiatement exploitables dans les champs des producteurs. Il a également identifié des variétés, dotées d’une bonne compétitivité vis-à-vis des adventices, qui peuvent être recommandées aux paysans.

« Les résultats de ses travaux de recherche sur la résistance des variétés de riz aux adventices parasites seront très utiles pour les programmes de sélection rizicoles » a déclaré Dr Marco Wopereis, Directeur général adjoint charge de la recherche pour le développement, «  si le choix des semences permet aux  producteurs pauvres de  lutter contre les adventices – cela constituera une avancée majeure, car à ce jour,  seules les approches de gestion des cultures sont disponibles pour lutter contre ces adventices ».

Selon les experts d’AfricaRice, les pertes de production rizicole en ASS imputées aux adventices représentent près de la moitié des importations de riz actuelles de la région, et les petits producteurs disposent d'une gamme limitée de technologies efficaces et abordables de gestion des adventices.

Dr Rodenburg supervise de nombreux étudiants en master et en doctorat de diverses origines. De plus, il a constitué un large réseau de partenaires de recherche en Afrique et à travers le globe.  Il est un chercheur prolifique qui contribue également à l’élaboration de supports de formation pour les producteurs telles que les vidéos, les scripts radios et les fiches techniques.

Friday, November 18, 2011

Launch of Africa Rice Agronomy Task Force and Rice Processing and Value Addition Task Force


The Rice Agronomy and Rice Processing and Value Addition Task Forces were launched at AfricaRice temporary headquarters in Cotonou, 15–18 November. The launch workshop was attended by participants from 14 African countries. Issues relating to mechanization are dealt within these two Task Forces.

By end 2011, all of the Task Forces proposed in the Strategic Plan had become operational, with the exception of the Mechanization Task Force, which is expected to become a joint ‘working group’ of the Agronomy and the Processing and Value Addition Task Forces.

Recent research on rice diseases in Africa

The recent dramatic increase in world rice prices drastically affected African countries, which are heavily dependent on rice imports. Consequently, many African countries are trying hard to develop their largely unexploited rice potential to boost domestic production. However, both expansion (the development of new areas) and intensification of rice cultivation will bring new problems, including diseases.


Three main diseases are hampering the effort to intensify rice cultivation in Africa: rice blast (due to pathogenic fungus Magnaporthe oryzae), bacterial blight (caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae) and rice yellow mottle disease (initiated by a Sobemovirus).

 
Rice yellow mottle virus (RYMV) was first observed in Kenya in the late 1960s. It is now a major disease of rice in the irrigated and lowland ecologies in almost all rice-producing countries in Africa, causing yield losses of 25–100% (depending on the rice variety grown).

For a long time, breeders had access to only one gene for RYMV resistance (rymv1), albeit in four versions — one (rymv1-2) available in an indica variety (Gigante) originating from Mozambique and the others (rymv1-3, rymv1-4 and rymv1-5) in Oryza glaberrima landraces (TOG5681, TOG 5672 and TOG5674, respectively).



These O. glaberrima genes are in several of the Lowland NERICA varieties. Subsequently, a second gene for RYMV resistance was found in O. glaberrima (RYMV2). Unfortunately, there are natural resistance-breaking isolates of the virus. This means that if we release a variety with one of the resistance genes into a hotspot area, the resistance-breaking viruses will survive and multiply, so that the final state is no better than the first!



As an insurance policy against this happening, the AfricaRice breeding strategy is to combine two resistance genes in varieties for release in hotspot areas. This work is being done in collaboration with Institut de recherche pour le développement (IRD).


In addition, since it has been shown that the occurrence of resistance-breaking strains is correlated with high disease inoculum, AfricaRice is seeking ways to reduce the disease pressure as a component of an integrated management system to reinforce the durability of the resistance.



Screening for RYMV resistance is conducted in a screenhouse in Cotonou, Benin. The screenhouse is designed to prevent the disease from escaping into the ‘wild’. Segregating populations (the offspring of crosses that are not yet true-breeding) are mechanically inoculated with the virus, and the disease is allowed to run its course.

In addition to visible symptoms, we now have access to three molecular markers for RYMV resistance, which can be detected in the laboratory to show the presence or absence of the resistance gene (or genes) in any particular plant.



Blast disease affects (particularly upland) rice in most parts of the world, inflicting yield losses of 70–80% under disease-favorable conditions. Bacterial blight (BB) has been known in Africa since the late 1970s in the irrigated ecology of the savannah and Sahel regions — yield losses attributable to BB are in the range of 20 to 78% in Southeast Asia and India.


There are several known major resistance genes for each of these diseases (blast resistance: Pi1, Pi2, Pia; BB resistance: Xa1, Xa2, … Xa26), but these are not durable, so new pathogens can emerge and ‘break’ the resistance conferred by these genes. The aim of the AfricaRice breeding program is to combine (pyramid) two or more of these non-durable resistance genes into varieties for farmers.



In addition, some major genes that induce partial durable resistance to blast in Asia (e.g. Pi40) will be tested under African conditions to see if they can be used to protect African rice varieties against blast disease.


The plant pathology laboratory is working in collaboration with the Japan International Research Center for Agricultural Science (JIRCAS) and the Green Super Rice project to determine which resistance genes are best for which populations of the disease — this will indicate the best candidates for pyramiding.


For both diseases, artificial screening of breeding and introduced material will soon be conducted in a climate-controlled greenhouse (expected to be operational in mid-2012).

Les travaux récents sur les maladies du riz en Afrique


L’augmentation spectaculaire récente des prix du riz a considérablement affecté les pays africains qui dépendent fortement des importations de riz. Subséquemment, plusieurs pays africains ne ménagent aucun effort en vue de développer leur potentiel rizicole largement inexploité en vue de relancer la production locale.

Cependant, l’expansion (la mise en valeur de nouvelles superficies) et l’intensification de la riziculture engendreront de nouveaux défis, y compris les maladies.

Les trois principales maladies qui entravent les efforts d’intensification de la riziculture sont les suivantes : La pyriculariose (due au champignon pathogène Magnaporthe oryzae), le flétrissement bactérien (causé par Xanthomonas oryzae pv. oryzae) et le virus de la panachure jaune (causé par un Sobemovirus).

Le virus de la panachure jaune (RYMV) a été découvert au Kenya à la fin des années 1960. Il s’agit d’une principale maladie du riz des écologies irriguées et des bas-fonds dans presque tous les pays producteurs de riz en Afrique. Cette maladie cause des pertes de rendement de l’ordre de 25 % –100 % (selon la variété de riz cultivée).

Pendant longtemps, les sélectionneurs ont eu accès à un seul gène de résistance au RYMV (rymv1), bien qu’en quatre versions : une (rymv1-2) que l’on retrouve chez une variété indica (Gigante) originaire du Mozambique et les autres (rymv1-3, rymv1-4 and rymv1-5) chez les landraces d’Oryza glaberrima (TOG5681, TOG 5672 et TOG5674, respectivement).

On retrouve ces gènes O. glaberrima chez plusieurs variétés de NERICA de bas-fonds. Par conséquent, un second gène de résistance au RYMV a été trouvé chez O. glaberrima (RYMV2).

Malheureusement, il existe des isolats du virus naturellement virulents. Cela signifie que si nous homologuons une variété dotée d’un des gènes de résistance dans une zone à forte prévalence, les virus virulents survivrons et pourront se multiplier, au final nous nous retrouvons donc à la case départ.

Afin de prévenir un tel scénario, la stratégie d’amélioration variétale d’AfricaRice est de combiner deux gènes de résistance chez des variétés en vue de leur homologation dans les zones à forte prévalence. Ces travaux sont menés en collaboration avec l’Institut de recherche pour le développement (IRD).

De plus, étant donné qu’il a été démontré que l’occurrence des souches virulentes est corrélée à un inoculum important de la maladie, AfricaRice cherche des moyens de réduire la pression de la maladie dans le cadre d’un volet du système de gestion intégré en vue de renforcer la durabilité de la résistance.

Le criblage pour la résistance au RYMV est mené dans une serre à Cotonou, Bénin qui est conçue pour empêcher la maladie de se transmettre à la nature environnante. Le virus est inoculé mécaniquement aux lignées en disjonction (la descendance des croisements non encore fixés), et la maladie suit son court. Outre les symptômes visibles, nous avons à présent accès à trois marqueurs moléculaires pour la résistance au RYMV, qui peuvent être détectés au laboratoire pour montrer la présence ou l’absence du gène (ou gènes) de résistance chez une plante spécifique.

La Pyriculariose affecte le riz (particulièrement de plateau) dans la plupart des régions du monde, infligeant des pertes de rendements de 70–80 % en conditions favorable à la maladie.

Le Flétrissement bactérien (BB) a été découvert en Afrique depuis la fin des années 1970 dans l’écologie irriguée des régions de la savanne et du Sahel. Les pertes en rendement imputées au BB se situent entre 20 et 78 % en Asie du Sud Est et en Inde. Il existe plusieurs gènes principaux connus de résistance à ces maladies (résistance à la pyriculariose : Pi1, Pi2, Pia; résistance au BB : Xa1, Xa2, …, Xa26), mais ces derniers ne sont pas durables.

Ainsi de nouveaux pathogènes peuvent apparaître et « briser » la résistance conférée par ces gènes. L’objectif du programme d’amélioration variétale d’AfricaRice est de combiner (pyramider) au moins deux de ces gènes de résistance non durables dans des variétés destinées aux producteurs.

Par ailleurs, certains gènes majeurs qui induisent une résistance durable à la pyriculariose en Asie (p. ex. Pi40) seront testés sous conditions africaine pour déterminer s’ils peuvent être utilisés pour protéger les variétés de riz africaines contre la pyriculariose.

Le laboratoire de phytopathologie travaille en collaboration avec le Centre international de recherche pour les sciences agricole du Japon (JIRCAS) et le projet « Green Super Rice » pour déterminer quels gènes de résistance sont les meilleurs et pour quel type de population de maladie – cela indiquera les meilleurs candidats pour le pyramidage.

Pour les deux maladies, le criblage artificiel de sélection et du matériel introduit sera bientôt mené dans une serre en climat contrôlé (qui devra être fonctionnel à la mi-2012).

Tuesday, November 15, 2011

JIRCAS 2011 International Symposium


AfricaRice DDG Marco Wopereis, gave a key note presentation on ‘Realizing Africa’s rice promise’ during the opening of the 2011 JIRCAS International Symposium, ‘Trends of International Rice Research and Japanese Scientific Contribution — Support to GRiSP and CARD’, Tsukuba International Congress Center, Epochal, Convention Hall 200, Tsukuba, Ibaraki, Japan, 14–15 November. The workshop was attended by about 120 people. AfricaRice weed scientist Jonne Rodenburg was awarded the prestigious 2011 Japan International Award for Young Agricultural Researchers for his work on weed science in Africa. He was one of the three awardees, the others being from the Philippines and Bangladesh.  

JIRCAS 2011 International Symposium


AfricaRice DDG Marco Wopereis, gave a keynote presentation on ‘Realizing Africa’s rice promise’ during the opening of the 2011 JIRCAS International Symposium, ‘Trends of International Rice Research and Japanese Scientific Contribution — Support to GRiSP and CARD’, Tsukuba International Congress Center, Epochal, Convention Hall 200, Tsukuba, Ibaraki, Japan, 14–15 November.

The workshop was attended by about 120 people. AfricaRice weed scientist Jonne Rodenburg was awarded the prestigious 2011 Japan International Award for Young Agricultural Researchers for his work on weed science in Africa. He was one of the three awardees, the others being from the Philippines and Bangladesh.