‘NIL
130’ a été nommée « meilleure variété de riz » sur sept en cours
d’évaluation par une coopérative de producteurs à Gagnoa, Côte d’Ivoire. NIL
130 est une ‘lignée quasi-isogénique’ issue de la variété de riz ‘élite’ IR64
par l’introduction d’un gène de résistance au Virus de la panachure jaune du
riz (RYMV) à travers un processus appelé ‘Sélection assistée par marqueurs’
(SAM).
«
Le RYMV est probablement le stress qui
implique davantage l’utilisation de la biologie moléculaire au Centre duriz pour l’Afrique (AfricaRice), » a déclaré Dr Marie-Noëlle Ndjiondjop,
biologiste moléculaire à AfricaRice. Le RYMV est appelée couramment « le SIDA
du riz » !
Les
travaux de SAM d’AfricaRice ciblant le RYMV se font en collaboration avec
l’Institut de recherche pour le développement (IRD), Montpellier, France, et
divers partenaires nationaux (SNRA).
AfricaRice
a eu une collaboration fructueuse avec l’IRD sur le RYMV depuis 1994, peu après
les premières apparitions dévastatrices de la maladie enregistrées dans
différentes parties de l’Afrique de l’Ouest.
Le
RYMV est une maladie de la production intensifiée du riz irrigué où des
variétés à haut rendement ont été introduites, et la grande majorité des
variétés irriguées sont extrêmement sensibles à cette maladie qui n’est
présente qu’en Afrique.
En
1995, AfricaRice a découvert qu’une variété venue du Mozambique (Gigante) était
presque immunisée contre le RYMV. La résistance de Gigante a été confirmée par Dr
Ndjiondjop contre toute une gamme d’isolats du RYMV provenant de diverses
localités.
La
priorité des priorités a donc été donnée à la détermination de la base
génétique de la résistance de Gigante. Le gène de résistance, rymv1-2, a été identifié et cartographié
en 1999 par Dr Ndjiondjop dans le cadre de ses études doctorales à l’IRD.
«
Nous utilisons à présent la sélection moléculaire pour améliorer la résistance
au RYMV des cultivars élites de riz d’Afrique de l’Ouest, » a déclaré
Ndjiondjop.
En
2005, un projet financé par l’USAID a permis à AfricaRice d’utiliser la SAM pour introgresser (c.-à-d.
incorporer ) rymv1-2 dans les
cultivars élites de riz de quatre pays d’Afrique de l’Ouest (Burkina Faso,
Gambie, Guinée et Mali) et d’introduire les travaux de marqueur moléculaire
dans les programmes de sélection des SNRA.
Au
moins deux variétés élites ont été proposées par chaque SNRA et rétrocroisées
trois fois avec le donneur Gigante. Les lignées résistantes ont été identifiées
à l’aide d’une combinaison des ‘gènes d’intérêt’ et du ‘fonds génétique’.
Les
gènes d’intérêt se trouvent dans l’ADN près du gène de résistance au RYMV chez
Gigante et montrent donc que toute plante possède ce gène, tandis que le fonds
génétique provient de la variété élite et fait ressortir la similitude de la
plante avec la variété élite.
Les
lignées issues de ce croisement sont des lignées quasi-isogéniques ou NIL —
c’est-à-dire qu’elles sont très similaires à la variété élite, à la différence
qu’elles portent le gène de résistance au RYMV issu de Gigante.
Les
lignées NIL prometteuses obtenues ont ensuite été criblées davantage en
conditions contrôlées en utilisant un isolat de virus purifié. Les essais ont
été réalisés dans des localités multiples dans les pays ciblés en vue de
confirmer leur résistance à diverses populations naturelles du RYMV.
Les
NIL (pures lignées de sélection) fixées résistantes au RYMV ont été ensuite
envoyées aux SNRA en vue d’une évaluation complète et d’une incorporation dans
les programmes de sélection pour la résistance.
La
meilleure NIL issue de chaque parent élite a été sélectionnée pour des essais
plus approfondis dans les quatre pays plus six autres pays (Côte d’Ivoire,
Ghana, Liberia, Niger, Nigeria, Sierra Leone).
Cette
activité a été financée par l’USAID à travers le Conseil Ouest et CentreAfricain pour la recherche et le développement agricole (CORAF/WECARD). Il est
prévu que beaucoup de ces lignées — à l’instar de NIL 130 — soient homologuées
dans certains de ces pays dans un futur proche.
En
2010, AfricaRice et l’IRD ont découvert un second gène de résistance, rymv2, et une nouvelle forme allélique
du premier gène chez les variétés de riz africain (Oryza glaberrima). En guise de politique d’assurance contre le RYMV
à contourner la résistance du gène unique, la stratégie de sélection
d’AfricaRice est de ‘pyramider’ deux gènes de résistance dans les variétés pour
les zones sensibles.
